土木工程學(xué)院是我校歷史最為悠久的院系之一，辦學(xué)歷史溯源于公立蒼霞中學(xué)堂于1908年開(kāi)設(shè)的土木科。其后，土木科隨著學(xué)校的更名，歷經(jīng)了福建公立工業(yè)專門學(xué)校（1914～1932）、福建省立高級(jí)工業(yè)職業(yè)學(xué)校（1933～1951）、福建省福州工業(yè)學(xué)校（1952～1953）、福州建筑工程學(xué)校（1953～1955）、城市建設(shè)總局福州城市建設(shè)工程學(xué)校（1956～1957）、福建建筑工程專科學(xué)校、福州建筑工程學(xué)校（并存，1958～1959）、福建建筑工程學(xué)院、福州建筑工程學(xué)校（并存，1960～1962）、福建建筑工程學(xué)校（1963～1969），受文革影響于1969年停辦。

1974年復(fù)辦福建建筑工程學(xué)校（中專），1978年復(fù)辦福建建筑工程專科學(xué)校（大專），1994年更名為福建建筑高等專科學(xué)校，原工業(yè)與民用建筑專業(yè)更名為房屋建筑工程專業(yè)，1997年房屋建筑工程專業(yè)被評(píng)為全國(guó)首批高等工程專科示范專業(yè)。

2002年福建建筑高等專科學(xué)校和福建職業(yè)技術(shù)學(xué)院合并組建福建工程學(xué)院，成立土木工程系，開(kāi)始招收土木工程專業(yè)本科生，2005年增設(shè)勘查技術(shù)與工程、交通工程兩個(gè)本科專業(yè)，2014年增設(shè)城市地下空間工程本科專業(yè)。2008年土木工程專業(yè)被評(píng)為國(guó)家級(jí)特色專業(yè)，2012年土木工程系更名為土木工程學(xué)院，2013年土木工程專業(yè)列為首批地方院校國(guó)家級(jí)專業(yè)綜合改革試點(diǎn)，2014年開(kāi)始招收碩士研究生（為我校首批三個(gè)一級(jí)學(xué)科碩士點(diǎn)之一），辦學(xué)層次和辦學(xué)水平得到進(jìn)一步提升。

百余年來(lái)，學(xué)校雖幾易其名，但土木科的開(kāi)設(shè)幾乎沒(méi)有中斷過(guò)，迄今已培養(yǎng)了萬(wàn)余名畢業(yè)生，為海峽兩岸輸送了大批建筑行業(yè)骨干，并涌現(xiàn)出了美國(guó)工程院院士林幼堃、臺(tái)灣大學(xué)著名教授盧衍琪、原全國(guó)僑聯(lián)主席林兆樞、原福建省政協(xié)主席游德馨等杰出人才，為福建省社會(huì)建設(shè)與經(jīng)濟(jì)發(fā)展做出了重大貢獻(xiàn)，我校也因此享有福建建筑業(yè)“黃埔軍校”之美譽(yù)！

走過(guò)百余年光榮歷程的土木工程學(xué)院，始終堅(jiān)持立德樹人的教育目標(biāo)，全面深化教育教學(xué)改革，致力于內(nèi)涵式發(fā)展，如今，全體土木人團(tuán)結(jié)一致、眾志成城，立志為學(xué)院發(fā)展續(xù)寫新輝煌，為我校的內(nèi)涵建設(shè)和轉(zhuǎn)型發(fā)展作出新貢獻(xiàn)！